42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0565 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  62.65 
 
 		 505 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  61.45 
 
 		 498 aa  671    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  87.17 
 
 		 499 aa  946    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  100 
 
 		 499 aa  1045    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  99.4 
 
 		 499 aa  1039    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  65.39 
 
 		 499 aa  732    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 		 439 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  29.63 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  24.56 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  27.48 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  27.1 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  24.58 
 
 		 1204 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  25.65 
 
 		 605 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  27.32 
 
 		 1121 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.54 
 
 		 682 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 581 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  29.63 
 
 		 325 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  23.88 
 
 		 709 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 		 583 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  25.63 
 
 		 523 aa  47  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 450 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 		 731 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7174  serine/threonine protein kinase  23.47 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00871383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  24.46 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 		 603 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_25974  predicted protein  36.99 
 
 		 733 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3510  serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 1192 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  22.53 
 
 		 673 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  24.32 
 
 		 663 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 		 573 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  25.62 
 
 		 651 aa  43.9  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  31.76 
 
 		 2279 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48613  serine/threonine kinase  27.34 
 
 		 297 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 		 344 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>