30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1080    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  27.87 
 
 		 703 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.87 
 
 		 739 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  25.99 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  25.08 
 
 		 709 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  25 
 
 		 673 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 732 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 731 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 		 1204 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  25.5 
 
 		 1121 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  23.4 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  23.08 
 
 		 646 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  22.19 
 
 		 648 aa  57  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  22.19 
 
 		 646 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  22.19 
 
 		 631 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  27.73 
 
 		 614 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  22.19 
 
 		 648 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  22.19 
 
 		 646 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  22.19 
 
 		 646 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  26 
 
 		 762 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  22.76 
 
 		 635 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 404 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  27.09 
 
 		 663 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.06 
 
 		 682 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 1070 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  29.05 
 
 		 202 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  25.63 
 
 		 499 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  25.63 
 
 		 499 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.52 
 
 		 2017 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>