29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2363 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  96.26 
 
 
648 aa  1271    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  96.44 
 
 
646 aa  1283    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  96.35 
 
 
631 aa  1249    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  97.21 
 
 
646 aa  1290    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  96.75 
 
 
646 aa  1285    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  95.95 
 
 
648 aa  1264    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  96.42 
 
 
648 aa  1273    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  100 
 
 
646 aa  1339    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  97.63 
 
 
635 aa  1269    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  36.28 
 
 
663 aa  404  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  35.01 
 
 
605 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  31.9 
 
 
703 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.9 
 
 
739 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
731 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 
732 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  34.17 
 
 
709 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  31.9 
 
 
762 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  32.78 
 
 
1204 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.75 
 
 
682 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
404 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  29.02 
 
 
1121 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  27.74 
 
 
673 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
400 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  28.73 
 
 
202 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  23.08 
 
 
523 aa  57.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  21.58 
 
 
614 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
447 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1641  hypothetical protein  25.23 
 
 
399 aa  47.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 
746 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>