30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0990 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  96.3 
 
 		 648 aa  1281    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  96.11 
 
 		 646 aa  1265    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  97.15 
 
 		 631 aa  1256    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  96.26 
 
 		 646 aa  1263    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  96.11 
 
 		 646 aa  1263    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1342    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  96.14 
 
 		 648 aa  1280    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  95.95 
 
 		 646 aa  1264    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  97.01 
 
 		 635 aa  1263    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  36.59 
 
 		 663 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  34.73 
 
 		 605 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  31.1 
 
 		 703 aa  250  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.1 
 
 		 739 aa  250  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  34.77 
 
 		 731 aa  208  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 732 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  33.23 
 
 		 709 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  31.12 
 
 		 762 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  32.44 
 
 		 1204 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.04 
 
 		 682 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  28.67 
 
 		 1121 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  30.22 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  26.59 
 
 		 202 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  23.4 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1641  hypothetical protein  25.96 
 
 		 399 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  21.22 
 
 		 614 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 		 746 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3878  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 396 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.402263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>