22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2211 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  100 
 
 
614 aa  1266    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  24.48 
 
 
709 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  27.73 
 
 
523 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  28.29 
 
 
202 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
404 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
731 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  21.4 
 
 
663 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  21.58 
 
 
646 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 
732 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  21.86 
 
 
646 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  21.86 
 
 
646 aa  49.7  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  21.51 
 
 
648 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  22.22 
 
 
739 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  21.22 
 
 
648 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  21.51 
 
 
648 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  22.22 
 
 
703 aa  47.4  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  25.29 
 
 
1204 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  21.51 
 
 
631 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  21.51 
 
 
646 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  21.22 
 
 
635 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
538 aa  45.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  26.32 
 
 
673 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>