42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2828 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  100 
 
 		 709 aa  1439    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  53.5 
 
 		 731 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  54.63 
 
 		 732 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  41.27 
 
 		 762 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.52 
 
 		 682 aa  256  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  37.92 
 
 		 1204 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  37.91 
 
 		 605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  38.41 
 
 		 663 aa  187  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  34.91 
 
 		 703 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  34.91 
 
 		 739 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  33.75 
 
 		 646 aa  170  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  34.17 
 
 		 646 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  33.75 
 
 		 635 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  33.75 
 
 		 648 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  33.96 
 
 		 631 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  33.96 
 
 		 646 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  33.75 
 
 		 648 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  33.23 
 
 		 648 aa  167  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  33.96 
 
 		 646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 		 404 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  33.56 
 
 		 1121 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1125  hypothetical protein  37.85 
 
 		 290 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  33.62 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  25.08 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  26.67 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  31.35 
 
 		 202 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  24.48 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  25.91 
 
 		 499 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 439 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  24.03 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 		 499 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  26.22 
 
 		 505 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0224  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 1295 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  23.79 
 
 		 499 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  23.79 
 
 		 499 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  25.96 
 
 		 444 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  26.38 
 
 		 498 aa  45.4  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 1188 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  24.15 
 
 		 475 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  31.25 
 
 		 1788 aa  44.3  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2671  serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 552 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>