38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4664 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  60.36 
 
 
498 aa  662    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  65.39 
 
 
499 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  65.39 
 
 
499 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  66 
 
 
499 aa  743    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
499 aa  1042    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  58.61 
 
 
505 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 
472 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
439 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  27.85 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  25 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  27.23 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  28.07 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  25.89 
 
 
762 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  24.81 
 
 
709 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.4 
 
 
553 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  22.41 
 
 
1204 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  24.88 
 
 
1121 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.81 
 
 
682 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3487  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
1341 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 
732 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0358  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
997 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0296381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
1726 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
404 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 
344 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
450 aa  47.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
502 aa  47.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4380  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.08 
 
 
1153 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594701  normal  0.339679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4878  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
622 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.181716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  27.78 
 
 
325 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
1188 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 
611 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 
605 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_25974  predicted protein  37.18 
 
 
733 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1978  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 
473 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3510  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 
363 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  33.33 
 
 
579 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5860  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
482 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.628207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
517 aa  43.5  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>