50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2725 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  100 
 
 
1121 aa  2282    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  33.56 
 
 
709 aa  151  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
731 aa  149  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
732 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.87 
 
 
682 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  29.37 
 
 
635 aa  119  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  26.12 
 
 
648 aa  118  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  29.02 
 
 
648 aa  118  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  29.71 
 
 
605 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  27.46 
 
 
762 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  29.02 
 
 
646 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  28.67 
 
 
646 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  28.67 
 
 
631 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  24.83 
 
 
1204 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  28.67 
 
 
646 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  28.67 
 
 
648 aa  114  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  28.32 
 
 
646 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  29.9 
 
 
739 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  29.9 
 
 
703 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
404 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  27.67 
 
 
663 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  29.73 
 
 
452 aa  102  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
400 aa  95.5  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  26.19 
 
 
673 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  22.82 
 
 
431 aa  64.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  28.02 
 
 
498 aa  63.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  25.5 
 
 
523 aa  59.3  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  27.8 
 
 
499 aa  58.2  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  27.8 
 
 
499 aa  57.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  27.32 
 
 
499 aa  56.2  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  23.69 
 
 
439 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  25.87 
 
 
444 aa  54.7  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 
447 aa  54.7  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
416 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  32.23 
 
 
325 aa  52  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  27.27 
 
 
505 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2671  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
552 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35463  predicted protein  30.1 
 
 
327 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.354987  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 
499 aa  49.7  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5989  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
496 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382918  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
618 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  23.22 
 
 
475 aa  48.9  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  24.72 
 
 
202 aa  48.9  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04717  cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit (Eurofung)  31.19 
 
 
396 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.798366  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  31.19 
 
 
571 aa  48.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_006686  CND04050  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 
473 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50582  predicted protein  30.63 
 
 
336 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.193781 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05815  Putative aurora kinase (Eurofung)  27.66 
 
 
391 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.583973  normal  0.683982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
898 aa  45.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
842 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>