28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2211 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  99.85 
 
 		 648 aa  1339    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  96.57 
 
 		 646 aa  1274    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  97.46 
 
 		 631 aa  1264    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  95.79 
 
 		 646 aa  1263    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  96.57 
 
 		 646 aa  1272    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  96.14 
 
 		 648 aa  1280    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1342    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  96.42 
 
 		 646 aa  1274    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  98.11 
 
 		 635 aa  1295    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  36.93 
 
 		 663 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  35.01 
 
 		 605 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  31.79 
 
 		 703 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.79 
 
 		 739 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 731 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 732 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  33.75 
 
 		 709 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  32.02 
 
 		 762 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  32.78 
 
 		 1204 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.34 
 
 		 682 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 404 aa  144  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  29.02 
 
 		 1121 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  27.71 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 		 400 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  26.82 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  22.19 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1641  hypothetical protein  25.56 
 
 		 399 aa  48.5  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  21.51 
 
 		 614 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>