19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1641 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  782    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7836  hypothetical protein  53.87 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1496  hypothetical protein  55.35 
 
 		 498 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5989  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3581  hypothetical protein  31.34 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.310599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7174  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00871383  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  25.88 
 
 		 646 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  25.88 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  25.56 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  25.96 
 
 		 648 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  25.56 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  25.63 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  25.23 
 
 		 646 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  25.56 
 
 		 646 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  27.23 
 
 		 646 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  25.51 
 
 		 663 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.07 
 
 		 1888 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  24.22 
 
 		 739 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  24.22 
 
 		 703 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>