43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0635 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  100 
 
 
663 aa  1372    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  38.96 
 
 
605 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  36.78 
 
 
648 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  36.93 
 
 
646 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  36.78 
 
 
648 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  37.09 
 
 
631 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  36.63 
 
 
646 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  36.63 
 
 
646 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  36.63 
 
 
648 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  36.62 
 
 
635 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  36.32 
 
 
646 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  30.72 
 
 
703 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  30.72 
 
 
739 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
731 aa  211  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  40.06 
 
 
732 aa  207  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  38.41 
 
 
709 aa  204  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  34.82 
 
 
762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.51 
 
 
682 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  32.54 
 
 
1204 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
404 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  27.67 
 
 
1121 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  29.3 
 
 
673 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
400 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  31.67 
 
 
202 aa  77  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  27.09 
 
 
523 aa  69.7  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  24.59 
 
 
499 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  24.86 
 
 
499 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  24.32 
 
 
499 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  24.35 
 
 
452 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  24.03 
 
 
498 aa  57.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  22.86 
 
 
614 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4664  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
499 aa  54.3  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.109697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2671  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
552 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  23.21 
 
 
431 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  22.97 
 
 
475 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  23.75 
 
 
439 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5989  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
496 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1641  hypothetical protein  23.97 
 
 
399 aa  47.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3704  hypothetical protein  27.45 
 
 
168 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140282  hitchhiker  0.000000146723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1496  hypothetical protein  24.88 
 
 
498 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  24 
 
 
645 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7174  serine/threonine protein kinase  20.32 
 
 
377 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00871383  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.3 
 
 
553 aa  44.3  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>