34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3004 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3004  protein kinase  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4761  hypothetical protein  47.8 
 
 		 673 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.479524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 		 762 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0635  hypothetical protein  31.67 
 
 		 663 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  27.32 
 
 		 703 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.32 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 731 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.34 
 
 		 682 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  31.35 
 
 		 709 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  27.62 
 
 		 646 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 732 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  27.78 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  26.82 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  26.82 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  28.18 
 
 		 646 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  28.18 
 
 		 646 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  27.17 
 
 		 635 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  27.17 
 
 		 631 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  26.59 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  29.34 
 
 		 1204 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0484  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2109  hypothetical protein  26.35 
 
 		 605 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.92156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2211  hypothetical protein  28.29 
 
 		 614 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.80254  normal  0.25915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  24.72 
 
 		 1121 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 		 450 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1078  serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259882  normal  0.342798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  29.05 
 
 		 523 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 439 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 404 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4035  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5575  Serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 333 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  29.14 
 
 		 331 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0130  aminoglycoside phosphotransferase  25.34 
 
 		 314 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.670297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  25.14 
 
 		 431 aa  41.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>