139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4195 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4195  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
447 aa  922    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0555562 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4257  protein kinase  31.13 
 
 
475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28671  hypothetical protein  26.64 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2989  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
472 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0410  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.663027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0632  serine/threonine kinase-like protein  27.78 
 
 
498 aa  65.1  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1321  protein kinase  28.76 
 
 
452 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.401211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04020  protein kinase family protein  27.56 
 
 
431 aa  63.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.53 
 
 
863 aa  63.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0503  putative protein kinase  26.05 
 
 
499 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0565  putative kinase protein  26.18 
 
 
499 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3682  putative kinase protein  25.43 
 
 
499 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 
731 aa  56.6  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  24.22 
 
 
1340 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.52 
 
 
1242 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  28.09 
 
 
1330 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2725  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  25.7 
 
 
1121 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.29791  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1174  hypothetical protein  26.29 
 
 
505 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  26.56 
 
 
329 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  26.56 
 
 
329 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 
762 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.67 
 
 
1110 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  21.68 
 
 
1204 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 
505 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13600  hypothetical protein  28.4 
 
 
523 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
732 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.79 
 
 
880 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0168  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
362 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00403231  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
990 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2828  protein kinase/helix-hairpin-helix DNA-binding domain-containing proteins  24.03 
 
 
709 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647129  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3707  protein kinase  34.75 
 
 
348 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.66 
 
 
1148 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
1188 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  29.81 
 
 
1018 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 
455 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
1320 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1587  putative chaperonin  24.9 
 
 
648 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2211  hypothetical protein  24.9 
 
 
648 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 
563 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.34 
 
 
682 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2221  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 
979 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  36 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  33.64 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.59 
 
 
520 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
1321 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
537 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  29.59 
 
 
494 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2363  hypothetical protein  25.11 
 
 
646 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.28 
 
 
1205 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2681  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 
1273 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344562  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
710 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10893  predicted protein  29.46 
 
 
276 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866021  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08836  conserved hypothetical protein similar to p21-activated kinase (PAK) (Eurofung)  27.45 
 
 
825 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0315867  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3993  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 
711 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0921  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
685 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5989  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
496 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382918  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  26.49 
 
 
499 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.19 
 
 
517 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
1346 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01976  hypothetical protein  25 
 
 
646 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03300  protein kinase C, putative  30.08 
 
 
1086 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.218688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
1400 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59677  predicted protein  28.97 
 
 
440 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.778862 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81215  predicted protein  26.95 
 
 
1080 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.932909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0812  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  24.15 
 
 
889 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2229  protein kinase  26.72 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681599  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1776  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
527 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0915938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  30.95 
 
 
654 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1571  putative chaperonin  24.56 
 
 
635 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.794604  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1162  hypothetical protein  25 
 
 
646 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 
877 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
503 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01965  hypothetical protein  24.9 
 
 
631 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.99 
 
 
1036 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
673 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1539  putative protein kinase:Serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.806427  normal  0.094009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
776 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4000  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.4 
 
 
587 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  32.2 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
524 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  35.11 
 
 
620 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 
486 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0990  hypothetical protein  24.55 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.169795 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1994  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0495985  normal  0.225513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3008  hypothetical protein  25.54 
 
 
646 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.351476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2671  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
552 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
723 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  27.31 
 
 
331 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3468  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
463 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1111  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
527 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0331309  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0466  Serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
713 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  29.41 
 
 
1032 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  29.41 
 
 
1032 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>