More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2127 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2127  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
345 aa  699    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.429011  normal  0.706941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3498  protein kinase  69.25 
 
 
459 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.744246  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3033  serine/threonine protein kinase  35.67 
 
 
461 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  35.86 
 
 
586 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.01 
 
 
880 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  33.9 
 
 
889 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  35.07 
 
 
583 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  32.14 
 
 
502 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  33 
 
 
585 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
989 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 
618 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.41 
 
 
511 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  32.87 
 
 
531 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  32.03 
 
 
484 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  35.22 
 
 
457 aa  106  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
486 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  35.23 
 
 
599 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.95 
 
 
557 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
368 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.93 
 
 
666 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
520 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
1479 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
416 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
571 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
622 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.42 
 
 
667 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
638 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  31.09 
 
 
604 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
569 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
332 aa  100  3e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 
776 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.72 
 
 
641 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
554 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0120  serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
654 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183398 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41434  predicted protein  29.82 
 
 
517 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.324941  decreased coverage  0.00263322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  28.77 
 
 
586 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
750 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  31.44 
 
 
618 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.41 
 
 
863 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.41 
 
 
614 aa  99.8  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.79 
 
 
438 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
651 aa  98.6  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1165  serine/threonine protein kinase  33.92 
 
 
713 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  30.03 
 
 
476 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  35.59 
 
 
604 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.99 
 
 
916 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  32.62 
 
 
450 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.8 
 
 
602 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
530 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
604 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
673 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  35.59 
 
 
604 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.97 
 
 
662 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
754 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 
895 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
636 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
866 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
612 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
445 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
747 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.76 
 
 
668 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 
505 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.58 
 
 
664 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
706 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 
1415 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.39 
 
 
661 aa  96.3  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.72 
 
 
662 aa  95.9  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1195  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
516 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0453042  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
824 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1264  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
521 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
985 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
624 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 
601 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
671 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
624 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.33 
 
 
652 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
624 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 
475 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
510 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1135  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 
520 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
526 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
628 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
615 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2518  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
505 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43727  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
587 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  32.75 
 
 
587 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  32.75 
 
 
587 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.96 
 
 
625 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
763 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.63 
 
 
518 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  31.08 
 
 
593 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  31.31 
 
 
626 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
569 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.58 
 
 
650 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 
691 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
693 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>