More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3498 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3498  protein kinase  100 
 
 
459 aa  940    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.744246  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2127  serine/threonine protein kinase  69.25 
 
 
345 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.429011  normal  0.706941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3033  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 
461 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.91 
 
 
557 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  34.02 
 
 
638 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33 
 
 
880 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  33 
 
 
889 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  35.29 
 
 
586 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0120  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
654 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183398 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  32.61 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  33.93 
 
 
583 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
618 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 
520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
989 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
490 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 
569 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  33.22 
 
 
531 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 
622 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
585 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  32.74 
 
 
502 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
416 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
750 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  33.22 
 
 
368 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
604 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  36.43 
 
 
604 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  36.43 
 
 
604 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3670  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
562 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215762  hitchhiker  0.000328552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.89 
 
 
604 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
754 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3039  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
735 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
706 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  36.2 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
533 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  31.74 
 
 
554 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  31.94 
 
 
643 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.57 
 
 
666 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
569 aa  97.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1195  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
516 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0453042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
746 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8116  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.82 
 
 
654 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1264  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
521 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  31.21 
 
 
790 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
535 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1135  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 
520 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  29.41 
 
 
662 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  32.99 
 
 
626 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
647 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41434  predicted protein  34.35 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.324941  decreased coverage  0.00263322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
569 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  31.69 
 
 
450 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
776 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
457 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.46 
 
 
438 aa  94.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
1479 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
898 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  32.62 
 
 
599 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
683 aa  94  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  32.85 
 
 
486 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  29.29 
 
 
586 aa  94  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  31.31 
 
 
475 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1700  Serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
496 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0154574  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.52 
 
 
641 aa  93.6  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  30.24 
 
 
653 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  30.26 
 
 
569 aa  93.2  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
530 aa  93.2  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
652 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
542 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3310  Serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
563 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254724  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2155  serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
783 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.64 
 
 
503 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  32.16 
 
 
352 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2266  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.64 
 
 
764 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932872  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 
332 aa  92.8  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1165  serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 
713 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  27.24 
 
 
618 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12928  transmembrane serine/threonine-protein kinase I pknI  30.39 
 
 
585 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00758832  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
866 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 
623 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
587 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.52 
 
 
511 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 
505 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  31.15 
 
 
623 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  31.51 
 
 
587 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  31.15 
 
 
621 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.82 
 
 
667 aa  92.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  31.51 
 
 
587 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
571 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
678 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  29.62 
 
 
673 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.37 
 
 
476 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.28 
 
 
916 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.31 
 
 
562 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.15 
 
 
715 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 
1398 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  31.19 
 
 
485 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30 
 
 
863 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>