More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3154 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
713 aa  1485    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0982  serine/threonine protein kinase  36.87 
 
 
702 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2542  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
447 aa  163  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3032  hypothetical protein  74.03 
 
 
78 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2130  serine/threonine protein kinase  23.06 
 
 
894 aa  90.5  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0710537  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 
865 aa  84.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 
1415 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  35.03 
 
 
869 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
776 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0657  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
566 aa  79.7  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  32.12 
 
 
625 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1655  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0659373  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.77 
 
 
681 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.28 
 
 
687 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
625 aa  78.2  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  24.58 
 
 
895 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  28.57 
 
 
651 aa  77.4  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 
660 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
624 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
624 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
624 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  31.39 
 
 
625 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2084  Serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000649074  unclonable  0.000000262207 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.34 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
870 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.11 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7441  Serine/threonine protein kinase-like protein  23.36 
 
 
873 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.91 
 
 
618 aa  75.1  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
566 aa  75.1  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
598 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.46 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  23.71 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.01 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  25.48 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  25.53 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.89 
 
 
943 aa  74.3  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  31.39 
 
 
626 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
416 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 
608 aa  73.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2457  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 
512 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
486 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 
700 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
835 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.2 
 
 
664 aa  72.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  30 
 
 
668 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
505 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 
646 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4064  protein kinase  27.32 
 
 
863 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.731546  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4513  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
644 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.228895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
642 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
517 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3927  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
1136 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  27.09 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 
623 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 
608 aa  72  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.26 
 
 
1183 aa  71.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2109  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.09 
 
 
777 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 
792 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.59 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 
862 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
573 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
464 aa  71.2  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.17 
 
 
553 aa  71.2  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.2 
 
 
635 aa  71.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.45 
 
 
652 aa  71.2  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.84 
 
 
682 aa  71.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.1 
 
 
551 aa  70.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.74 
 
 
653 aa  70.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  23.16 
 
 
661 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 
602 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6469  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
662 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 
780 aa  70.5  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
691 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.97 
 
 
668 aa  70.5  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2006  Lanthionine synthetase C family protein  26.04 
 
 
1078 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.517498  normal  0.231336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  26.09 
 
 
574 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1979  Lanthionine synthetase C family protein  25.38 
 
 
1078 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
673 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.64 
 
 
593 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
985 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 
550 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2809  Serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
566 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0136026  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.47 
 
 
707 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 
820 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  24.57 
 
 
623 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 
754 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.81 
 
 
557 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  27.04 
 
 
621 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0681  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
465 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4592  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
598 aa  68.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.66 
 
 
662 aa  69.3  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>