105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0316 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2796  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
266 aa  165  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140151  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  34.34 
 
 
466 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  34.45 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  31.93 
 
 
284 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  26.7 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  31.09 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  34.13 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  33.66 
 
 
243 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  29.41 
 
 
285 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  33 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  30.25 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  28.45 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
465 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0453  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  32.67 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  29.41 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  29.41 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  28 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05790  STE20  32.84 
 
 
644 aa  49.3  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  31.58 
 
 
286 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
871 aa  48.9  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  29.41 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  27.27 
 
 
1100 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  30.25 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
928 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  28.57 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1777  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
620 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00817012  normal  0.221734 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  29.41 
 
 
283 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  29.41 
 
 
297 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  29.06 
 
 
282 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13350  protein kinase family protein  42.31 
 
 
561 aa  47  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0363  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
497 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  30.25 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  28.57 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  28.45 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  28.45 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  28.45 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2497  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  27.33 
 
 
739 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  26.89 
 
 
295 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  27.73 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84188  serine/threonine kinase  35.82 
 
 
353 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  29.41 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
639 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2877  hypothetical protein  27.67 
 
 
703 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
639 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3747  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
619 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.350974  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 
615 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02140  hypothetical protein  30.95 
 
 
1430 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.928368  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00140  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
781 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.505175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  28.57 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  29.41 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.62 
 
 
1072 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.73 
 
 
627 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
503 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08836  conserved hypothetical protein similar to p21-activated kinase (PAK) (Eurofung)  33.33 
 
 
825 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0315867  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02067  Serine/threonine-protein kinase ste20 (EC 2.7.11.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL3]  32.86 
 
 
848 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00224499  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  29.41 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  29.33 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  28.82 
 
 
502 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  32 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  33.62 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82371  predicted protein  33.33 
 
 
835 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136498  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  32.29 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 
569 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2266  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.77 
 
 
764 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4064  protein kinase  27.85 
 
 
863 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.731546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
641 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
596 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
972 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
468 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00400  conserved hypothetical protein  41.3 
 
 
1326 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1442  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33003  predicted protein  25.18 
 
 
366 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  27.41 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  30.7 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1065  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 
577 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
573 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  24.74 
 
 
963 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
286 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4831  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.66 
 
 
1599 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.71 
 
 
499 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3248  serine/threonine protein kinase  48.65 
 
 
752 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  34.72 
 
 
643 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.71 
 
 
898 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  33.58 
 
 
239 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3401  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
460 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>