61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0105 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 240 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  75.63 
 
 		 252 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  69.62 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  64.49 
 
 		 251 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.33 
 
 		 241 aa  331  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.67 
 
 		 251 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.11 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.86 
 
 		 251 aa  324  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  64.46 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.89 
 
 		 250 aa  321  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.45 
 
 		 251 aa  321  8e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  60.98 
 
 		 250 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.33 
 
 		 249 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.2 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.79 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.44 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  50.93 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  46.76 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.86 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.26 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.22 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  41.1 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.74 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.74 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.79 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.17 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.55 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.47 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  39.73 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.82 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.35 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.62 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.01 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.62 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.6 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0924  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  30.11 
 
 		 324 aa  49.3  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  31.25 
 
 		 387 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1369  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  32 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0825  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0324565 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  31.46 
 
 		 405 aa  45.4  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1531  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  21.88 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000195612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2439  serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 		 482 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1273  metalloendopeptidase, glycoprotease family  28.04 
 
 		 557 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0267289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 623 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 617 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2796  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  30.58 
 
 		 466 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.81 
 
 		 930 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 567 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  27.01 
 
 		 492 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0653  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  25.47 
 
 		 525 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  26.28 
 
 		 492 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  28.95 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  32.38 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0705  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.369661  hitchhiker  0.00000000383184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0279  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  37.84 
 
 		 545 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 996 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>