132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0163 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
284 aa  587  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  83.33 
 
 
286 aa  484  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  82.37 
 
 
282 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  82.37 
 
 
282 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  80.87 
 
 
308 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  79.14 
 
 
283 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  72.14 
 
 
282 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  67.04 
 
 
298 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  67.64 
 
 
297 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  67.04 
 
 
298 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  65.31 
 
 
298 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  67.27 
 
 
297 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  64.36 
 
 
295 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  64.41 
 
 
285 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  65.54 
 
 
314 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  64.77 
 
 
285 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  65.91 
 
 
297 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  62.28 
 
 
285 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  65.91 
 
 
297 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  65.91 
 
 
297 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  61.21 
 
 
285 aa  363  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  65.17 
 
 
275 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  62.32 
 
 
282 aa  362  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
285 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
285 aa  359  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
286 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
286 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
286 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
286 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  62.32 
 
 
278 aa  358  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
285 aa  358  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  64.59 
 
 
286 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  62.28 
 
 
285 aa  351  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  58.93 
 
 
287 aa  350  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  65.91 
 
 
285 aa  348  8e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
284 aa  345  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  61.87 
 
 
286 aa  343  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  59.93 
 
 
285 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  62.28 
 
 
283 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  62.28 
 
 
283 aa  338  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  62.28 
 
 
283 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  59.64 
 
 
284 aa  338  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  61.48 
 
 
284 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  59.85 
 
 
285 aa  334  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  58.21 
 
 
283 aa  334  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  56.83 
 
 
286 aa  333  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  58.78 
 
 
285 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  60 
 
 
299 aa  331  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  60.5 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  56.73 
 
 
286 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  46.89 
 
 
450 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  44.81 
 
 
417 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  44.81 
 
 
412 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  44.81 
 
 
411 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  37.27 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  36.28 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  33.94 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  38.73 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  35.71 
 
 
291 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  38.1 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  32.09 
 
 
246 aa  105  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3064  protein of unknown function RIO1  35.94 
 
 
308 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.128757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3291  protein of unknown function RIO1  37.32 
 
 
308 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  35.35 
 
 
387 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  36.19 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  33.02 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  34.12 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
248 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  32.77 
 
 
334 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  35.02 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  34.17 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  34.6 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  31.16 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  32.42 
 
 
622 aa  82  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  28.57 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  28.9 
 
 
558 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  32.67 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  30.23 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  29.25 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  31.94 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  34.03 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  28.75 
 
 
495 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  29.17 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  33.1 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  30.19 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  31.13 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  40 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  29.44 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  30 
 
 
1269 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  28.9 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  30.99 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>