42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1269 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  34.35 
 
 		 466 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  31.12 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  32.37 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  30.29 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  30.41 
 
 		 480 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  35.25 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  30.41 
 
 		 480 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  28.1 
 
 		 483 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  28.16 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  29.82 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  30.51 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  29.14 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  26.98 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  26.78 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  30.2 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1807  hypothetical protein  25.86 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  30.2 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06125  hypothetical protein  26.5 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0617  hypothetical protein  21.72 
 
 		 630 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0646208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  25.66 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  28.26 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2518  hypothetical protein  26.42 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.21 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  30.87 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  21.15 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  21.15 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  22.88 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  25 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1273  metalloendopeptidase, glycoprotease family  28.46 
 
 		 557 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  27.59 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2796  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1948  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0317  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  21.58 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  30.61 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0825  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0324565 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 		 190 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  29.09 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3007  hypothetical protein  25.66 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2225  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 215 aa  42  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000380991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>