16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4997 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  74.48 
 
 		 480 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  968    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  91.84 
 
 		 481 aa  851    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  80.29 
 
 		 483 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  68.3 
 
 		 492 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  74.48 
 
 		 480 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  73.64 
 
 		 480 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  74.69 
 
 		 480 aa  708    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  68.66 
 
 		 492 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  64.24 
 
 		 485 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  62.71 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  33.91 
 
 		 502 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 		 252 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  28.47 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  27.98 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 615 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>