19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0375 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  95.21 
 
 		 480 aa  913    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  73.64 
 
 		 481 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  74.11 
 
 		 481 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  74.21 
 
 		 483 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  92.5 
 
 		 480 aa  882    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  970    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  94.58 
 
 		 480 aa  907    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  66.39 
 
 		 492 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  63.96 
 
 		 485 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  65.98 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  62.08 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  32.4 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 		 252 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  25.15 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  31.11 
 
 		 243 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  30.34 
 
 		 324 aa  46.6  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2518  hypothetical protein  23.53 
 
 		 255 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 623 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  25.93 
 
 		 249 aa  43.5  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>