21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  950    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  69.33 
 
 
492 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  69.31 
 
 
492 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  64.24 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  65.41 
 
 
483 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  67.22 
 
 
481 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  63.96 
 
 
480 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  64.17 
 
 
480 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  64.15 
 
 
480 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  63.96 
 
 
480 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  62.71 
 
 
481 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  35.73 
 
 
502 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  31.06 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  31.85 
 
 
324 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1801  hypothetical protein  22.43 
 
 
252 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  31.48 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  30.17 
 
 
243 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.44 
 
 
242 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2518  hypothetical protein  22.65 
 
 
255 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  28.66 
 
 
249 aa  43.1  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>