22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1268 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  942    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  31.84 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  32.35 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  25.26 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  27.05 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  27.88 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  25.5 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  26.4 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  25.84 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  24.86 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  34.34 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  28.32 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  25.5 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2796  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 266 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  29.94 
 
 		 249 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  29.94 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  24.87 
 
 		 238 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15848  predicted protein  29.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.747848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  26.58 
 
 		 236 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  30.58 
 
 		 240 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>