23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0585 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  70.78 
 
 		 492 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  959    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  70.29 
 
 		 492 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  67.22 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  64.09 
 
 		 483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  64.38 
 
 		 480 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  64.17 
 
 		 480 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  62.5 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  63.12 
 
 		 480 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  62.5 
 
 		 481 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  63.75 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  34.04 
 
 		 502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  28.72 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0586  protein of unknown function RIO1  32.41 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.261932  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4944  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 		 639 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.438728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2518  hypothetical protein  20.56 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3082  predicted protein  28.17 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0293264  hitchhiker  0.0000000157294 
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  32.82 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2084  Serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 643 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000649074  unclonable  0.000000262207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  22.51 
 
 		 291 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 		 774 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 		 781 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>