17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2518 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2518  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06125  hypothetical protein  55.2 
 
 
254 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3007  hypothetical protein  42.4 
 
 
253 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0587  hypothetical protein  38.33 
 
 
244 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00125956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1801  hypothetical protein  36.14 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  35.76 
 
 
324 aa  99.4  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1398  hypothetical protein  30.28 
 
 
760 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  24.73 
 
 
480 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  24.73 
 
 
480 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  27.61 
 
 
502 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  20.56 
 
 
481 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  24.73 
 
 
480 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  23.53 
 
 
480 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  24.31 
 
 
483 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  25.14 
 
 
481 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0782  hypothetical protein  23.23 
 
 
415 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540249  normal  0.366312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>