19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4856 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  90.79 
 
 
480 aa  871    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  74.69 
 
 
481 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  74.53 
 
 
481 aa  690    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  75.89 
 
 
483 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  965    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  92.5 
 
 
480 aa  882    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  91 
 
 
480 aa  872    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  65.98 
 
 
492 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  64.15 
 
 
485 aa  604  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  65.57 
 
 
492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  62.5 
 
 
481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  32.9 
 
 
502 aa  206  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
252 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  28.4 
 
 
466 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  34.09 
 
 
324 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  31.11 
 
 
243 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.07 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2518  hypothetical protein  24.73 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  27.6 
 
 
244 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>