15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0526 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  74.48 
 
 
480 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  91.84 
 
 
481 aa  851    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  969    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  79.87 
 
 
483 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  67.62 
 
 
492 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  74.9 
 
 
480 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  74.11 
 
 
480 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  74.53 
 
 
480 aa  711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  67.48 
 
 
492 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  62.71 
 
 
485 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  62.5 
 
 
481 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  36.13 
 
 
502 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  27.98 
 
 
324 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  25.26 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>