16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0347 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  968    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4997  hypothetical protein  74.48 
 
 		 481 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0526  hypothetical protein  74.48 
 
 		 481 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0471  hypothetical protein  73.49 
 
 		 483 aa  688    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  98.96 
 
 		 480 aa  957    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  95.21 
 
 		 480 aa  913    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  90.79 
 
 		 480 aa  871    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66190  hypothetical protein  67.21 
 
 		 492 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5741  hypothetical protein  66.39 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44810  hypothetical protein  64.17 
 
 		 485 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0585  hypothetical protein  63.33 
 
 		 481 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.219547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0757  hypothetical protein  33.05 
 
 		 502 aa  209  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0585339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 252 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  25.93 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  31.03 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2518  hypothetical protein  24.73 
 
 		 255 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>