57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1357 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  96.39 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  64.26 
 
 		 249 aa  318  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  64.11 
 
 		 249 aa  318  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.95 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.09 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.36 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.14 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.32 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  36.77 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.87 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.78 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.54 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.62 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.54 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.91 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.12 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.49 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.54 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.86 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.39 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.51 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.23 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.55 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.38 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.87 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.81 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.97 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  35.27 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  35.27 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  35.42 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.81 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.36 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  42.31 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0453  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  29.94 
 
 		 466 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0825  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0324565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 		 605 aa  45.4  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1273  metalloendopeptidase, glycoprotease family  30.1 
 
 		 557 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2356  homoserine kinase  28.99 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  25.93 
 
 		 480 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0240  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  25.9 
 
 		 527 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211158  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  47.37 
 
 		 445 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1948  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0262  hypothetical protein  48.89 
 
 		 961 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0267  hypothetical protein  48.89 
 
 		 961 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1476  homoserine kinase  31.58 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  26.98 
 
 		 480 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  46.67 
 
 		 571 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01930  conserved hypothetical protein  36.73 
 
 		 1169 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 		 571 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  26.79 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 437 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  23.23 
 
 		 316 aa  42  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29 
 
 		 190 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>