50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  70.73 
 
 		 244 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  70.33 
 
 		 244 aa  347  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  69.11 
 
 		 244 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  68.7 
 
 		 244 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  68.7 
 
 		 244 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  67.48 
 
 		 244 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  67.48 
 
 		 244 aa  324  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  67.07 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  67.07 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  67.07 
 
 		 244 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  34.85 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  30.6 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  29.95 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  26.81 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  29.45 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  30.82 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  30.82 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  29.45 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  29.49 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  30.82 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  29.53 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  26.13 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  26.55 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  26.9 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  33.33 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  27.4 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  28.08 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  28.45 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  29.06 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0044  serine/threonine-protein kinase  31.07 
 
 		 489 aa  44.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0153881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  28.92 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  27.42 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  26.71 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  27.04 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  26.91 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.44 
 
 		 579 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 973 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  28.67 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  32.37 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06339  PAK-related kinase (Eurofung)  33.72 
 
 		 934 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 766 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 		 419 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 		 528 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  32.34 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  30.84 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1751  serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.868443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4540  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 444 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.261532  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  24.35 
 
 		 258 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>