44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0470 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  71.2 
 
 		 250 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  70.8 
 
 		 250 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  70.4 
 
 		 250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  70.4 
 
 		 250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  69.64 
 
 		 253 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  68.83 
 
 		 259 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  67.6 
 
 		 247 aa  338  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  63.71 
 
 		 252 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  62.87 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  36.53 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  37.76 
 
 		 234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  37.24 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  32.39 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  35.35 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  35.16 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  35.16 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  34.7 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  32.78 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  35.05 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  33.02 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  31.76 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  31.18 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  30.59 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  32.09 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  32.74 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  30.48 
 
 		 277 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  27.38 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  33.71 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  33.72 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  33.71 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  26.56 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  33.72 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  29.91 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  28.57 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  29.06 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  29.37 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  28.21 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>