41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0469 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 244 aa  503  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  81.56 
 
 		 244 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  80.74 
 
 		 244 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  78.28 
 
 		 244 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  77.46 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  77.05 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  76.23 
 
 		 244 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  75 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  75 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  68.44 
 
 		 244 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  70.85 
 
 		 246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  28.57 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  29.66 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  28.88 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  28.77 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  28.14 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  28.77 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  28.77 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  25.86 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  28.77 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  29.91 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  28.31 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  31.25 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  28.45 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  29.25 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  24.34 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  26.02 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  26.92 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  29.66 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  29.66 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  33.71 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.73 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  32.03 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  27.17 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  26.32 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  31.03 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  32.58 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  25.69 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  33.86 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  27.27 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26925  predicted protein  25.26 
 
 		 461 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>