34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0345 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  97.95 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  96.31 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  90.57 
 
 		 244 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  77.46 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  73.36 
 
 		 244 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  73.77 
 
 		 244 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  75.41 
 
 		 244 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  75 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  69.26 
 
 		 244 aa  353  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  69.06 
 
 		 246 aa  304  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  30.82 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  28.66 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  23.28 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  28.57 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  25.47 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  29.78 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  31.79 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.17 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  32.73 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  31.5 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  32.73 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  27.95 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  28.31 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  27.07 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  31.03 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  27.67 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  28.21 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  27.67 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  27.03 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  29.27 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  31.35 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  29.27 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  26.42 
 
 		 268 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>