59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0525 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  90.87 
 
 		 253 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  68.83 
 
 		 250 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  68.42 
 
 		 250 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  68.02 
 
 		 250 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  67.61 
 
 		 250 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  67.61 
 
 		 250 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  63.97 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  61.18 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  60.34 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  35.96 
 
 		 232 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  35.53 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  35.09 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  35.09 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  35.96 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  35.47 
 
 		 234 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  35.78 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  33.01 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  34.22 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  34.39 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  31.75 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  31.75 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  31.75 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  31.75 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  31.75 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  31.8 
 
 		 216 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  31.75 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  31.67 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  33.78 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  33.05 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  32.59 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  31.53 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  26.72 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  34.21 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  26.88 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  34.21 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  26.67 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  24.07 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0345  lipopolysaccharide kinase  28.66 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  24.22 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  28.47 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  24.06 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  26.46 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.47 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4858  lipopolysaccharide kinase  27.74 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  22.98 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0373  lipopolysaccharide kinase  26.83 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  21.66 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.93 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  25.93 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.93 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0524  lipopolysaccharide kinase  33.71 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  22.58 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  31.03 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  30.53 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3920  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  25.4 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.773448  hitchhiker  0.00444896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4999  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  32.58 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  22.04 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>