39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  98.81 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  68.92 
 
 		 247 aa  338  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  62.95 
 
 		 250 aa  321  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  61.35 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  60.56 
 
 		 250 aa  307  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  60.56 
 
 		 250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  60.56 
 
 		 250 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  59.68 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  59.68 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  33.97 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  35.75 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  35.75 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  35.45 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  35.87 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  30.99 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  31.28 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  30.99 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  30.99 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  31.28 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  30.99 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  30.99 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  30.99 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  35.43 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  33.19 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  35.51 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  34.3 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  35.51 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  35.05 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  34.7 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  34.27 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  33.67 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  28.57 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  23.89 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.65 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  23.89 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.65 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1948  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>