50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1364 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  34.48 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4067  lipopolysaccharide kinase  36.97 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.424153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66200  hypothetical protein  32.88 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0470  lipopolysaccharide kinase  32.78 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.375351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5742  hypothetical protein  32.43 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4495  lipopolysaccharide kinase  34.95 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4371  inaA protein  37.26 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3689  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0374  lipopolysaccharide kinase  31.82 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0943  lipopolysaccharide kinase  34.84 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0972  lipopolysaccharide kinase  35.29 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0904  lipopolysaccharide kinase  34.84 
 
 		 233 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0346  lipopolysaccharide kinase  31.84 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0371  lipopolysaccharide kinase  31.84 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17770  Lipopolysaccharide kinase  33.33 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4857  lipopolysaccharide kinase  30.99 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.616277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4483  lipopolysaccharide kinase  34.39 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0525  lipopolysaccharide kinase  33.05 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4998  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  34.11 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2486  lipopolysaccharide kinase  31.48 
 
 		 229 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000362881  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4949  lipopolysaccharide kinase InaA  34.39 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56920  InaA protein  34.39 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0584  lipopolysaccharide kinase  31.16 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  31.87 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  31.87 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  31.87 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  31.87 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  31.87 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  31.32 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  30.85 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  31.32 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0075  lipopolysaccharide kinase  30 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  29.94 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  29.75 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  28.19 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  26.6 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  28.19 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  29.11 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  27.66 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  26.63 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  29.3 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  24.76 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  28.21 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  27.34 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  27.1 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  27.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  27.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>