50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0778 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.45 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.79 
 
 
252 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.02 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.04 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.64 
 
 
241 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44.95 
 
 
249 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  47.74 
 
 
249 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.74 
 
 
258 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.67 
 
 
243 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  37.56 
 
 
236 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.04 
 
 
239 aa  148  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.46 
 
 
250 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.15 
 
 
250 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.35 
 
 
251 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.67 
 
 
253 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.72 
 
 
251 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.82 
 
 
240 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.86 
 
 
251 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.86 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.01 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.3 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.54 
 
 
250 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.62 
 
 
231 aa  134  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.7 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.5 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.92 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.92 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.15 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  35.38 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  37.89 
 
 
236 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.82 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.55 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  38.65 
 
 
236 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.97 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0924  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1531  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  23.45 
 
 
206 aa  48.9  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000195612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0705  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.369661  hitchhiker  0.00000000383184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1954  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  36.63 
 
 
553 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1369  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2225  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000380991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1195  O-sialoglycoprotein endopeptidase  25.17 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.112433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  24.76 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1948  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0825  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0324565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  29.93 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  28.69 
 
 
387 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  29.93 
 
 
244 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  29.05 
 
 
285 aa  41.6  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  34.04 
 
 
254 aa  42  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>