40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4101 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 250 aa  521  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  97.2 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  89.96 
 
 		 250 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  96 
 
 		 250 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  80.08 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  80.08 
 
 		 251 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  78.09 
 
 		 251 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  79.67 
 
 		 251 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  78.88 
 
 		 251 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.89 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.71 
 
 		 242 aa  308  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  59.35 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.13 
 
 		 249 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.79 
 
 		 240 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  57.96 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  56.28 
 
 		 250 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.29 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.06 
 
 		 239 aa  178  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.15 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.08 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  41.2 
 
 		 236 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.1 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.1 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.79 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  44 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.87 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.72 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.15 
 
 		 239 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.18 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.36 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.04 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.42 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  35.79 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.34 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0653  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  30 
 
 		 525 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 190 aa  45.4  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  29.37 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  34.15 
 
 		 272 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2247  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  27.07 
 
 		 527 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>