128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1194 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
285 aa  590  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  60.56 
 
 
285 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  56.18 
 
 
286 aa  345  5e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  55.83 
 
 
302 aa  342  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  51.94 
 
 
286 aa  311  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 
381 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
295 aa  241  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 
302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  41.04 
 
 
301 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  41.64 
 
 
304 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  42.35 
 
 
303 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 
301 aa  218  8.999999999999998e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  39.43 
 
 
288 aa  203  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  38.13 
 
 
301 aa  192  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  37.85 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  37.02 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  35.76 
 
 
298 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  35.42 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  34.91 
 
 
306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  36.73 
 
 
294 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  36.36 
 
 
306 aa  159  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  34.55 
 
 
306 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  31.72 
 
 
299 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  32.97 
 
 
320 aa  152  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  33.46 
 
 
526 aa  149  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  32.2 
 
 
302 aa  148  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  32.78 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  31.23 
 
 
316 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  32.23 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  29.12 
 
 
422 aa  139  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  29.29 
 
 
287 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
261 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  27.52 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  32.73 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  27.24 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  29.05 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  28.28 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  26.82 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  31.58 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
306 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  29.95 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  30.14 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  30.14 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  28.7 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  25 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  28.69 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  23.85 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  27.91 
 
 
495 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  27.4 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  33.54 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  26.32 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  36.29 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  32 
 
 
375 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  23.15 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  25.98 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  25.22 
 
 
622 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  31.33 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  27.59 
 
 
1269 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  31.01 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  28.22 
 
 
558 aa  59.3  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.19 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  30.19 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  32.79 
 
 
298 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  27.13 
 
 
284 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  33.61 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  26.37 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  30.38 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  29.75 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  24.4 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  26.67 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  28.7 
 
 
626 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  28.21 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  25.66 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  26.92 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  29.33 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  30.51 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  30.51 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  26.5 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  25.65 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  29.27 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  26.75 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  27.13 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  26.5 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  26.8 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  25 
 
 
285 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  25.81 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  26.39 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  27.73 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  28.33 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
190 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  28.48 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>