127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0533 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  72.15 
 
 		 302 aa  447  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  67.77 
 
 		 303 aa  433  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  67.89 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  67.11 
 
 		 301 aa  421  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  40.34 
 
 		 295 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  41.64 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  43.36 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  42.19 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  40.39 
 
 		 285 aa  212  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  39.45 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  41.22 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  34.57 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  36.96 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  36.84 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  36.99 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  36.99 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  33.77 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  36.64 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  37.37 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  31.1 
 
 		 422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  33.56 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  34.36 
 
 		 405 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  34.28 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 526 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  33.22 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  32.29 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  32.97 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  29.05 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0920719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  27.68 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  31.25 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  30.86 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  29.12 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  31.03 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  26.03 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  28.37 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  25 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  29.2 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  29.19 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  30.56 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  30.28 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  30.52 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  29.47 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  31.07 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  31.07 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.54 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  30.05 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  28.96 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  30.84 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  30.05 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  30.19 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  22.22 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  31.07 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  30.19 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  30.7 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  29.09 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  28.57 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  30.58 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  30.88 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  29.11 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  29.77 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  28.02 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  29.56 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  27.54 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  29.02 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  25.32 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  29.56 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  29.3 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  26.22 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  37.21 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  24.19 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  25.58 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  28.37 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  28.37 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  29.19 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  33.59 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  28.08 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  33.33 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  28.14 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  29.13 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  30.41 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  28.17 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  27.64 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  27.1 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  28.86 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  33.62 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  33.62 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  28.92 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  32.02 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>