129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33379 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  100 
 
 
422 aa  868    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  45.71 
 
 
405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  46.27 
 
 
320 aa  300  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  51.25 
 
 
526 aa  297  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  40.33 
 
 
299 aa  226  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  35.09 
 
 
301 aa  176  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  31.67 
 
 
301 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  30.28 
 
 
285 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  31.45 
 
 
303 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
302 aa  150  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
301 aa  150  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  32.99 
 
 
294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  31.1 
 
 
304 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
295 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  34.06 
 
 
288 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  32.18 
 
 
302 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  31.65 
 
 
306 aa  140  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  29.07 
 
 
285 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  36.8 
 
 
298 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  29.12 
 
 
286 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  36.8 
 
 
298 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  29.47 
 
 
316 aa  136  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  36.14 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  29.86 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  30.69 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
306 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  29.3 
 
 
302 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  30.9 
 
 
292 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  31.02 
 
 
285 aa  99.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  27.47 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  27 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  26.19 
 
 
258 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  24.18 
 
 
334 aa  79  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  25.59 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  26.61 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  25.2 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  25 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  25.23 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  25.43 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  26.56 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  24.77 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  24.64 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  24.29 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  27.57 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  26.85 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  25.76 
 
 
254 aa  63.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  26.85 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.76 
 
 
261 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  25.11 
 
 
622 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  26.27 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
270 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.76 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  26.32 
 
 
254 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  24.11 
 
 
246 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  23.98 
 
 
291 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  26.39 
 
 
285 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  26.67 
 
 
282 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  25.37 
 
 
285 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  24.65 
 
 
268 aa  60.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 
248 aa  60.1  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  25.36 
 
 
1269 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  25.91 
 
 
267 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  24.23 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  26.78 
 
 
280 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  24.14 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  25.49 
 
 
282 aa  56.6  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  26.63 
 
 
285 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  24.34 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  26.25 
 
 
626 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  23.15 
 
 
284 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  25.61 
 
 
240 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  23.5 
 
 
284 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  24.47 
 
 
286 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
282 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  31.45 
 
 
450 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  27.07 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  25.66 
 
 
308 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3064  protein of unknown function RIO1  30.86 
 
 
308 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.128757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  23.72 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  23.94 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  26.12 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  22.94 
 
 
285 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  23.16 
 
 
285 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  24.31 
 
 
297 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  27.27 
 
 
297 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  28.17 
 
 
298 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  27.61 
 
 
300 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  23.96 
 
 
297 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3291  protein of unknown function RIO1  25 
 
 
308 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  26.57 
 
 
297 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  26.76 
 
 
295 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  23.5 
 
 
297 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  24.77 
 
 
314 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  27.87 
 
 
296 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>