141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1977 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  65.57 
 
 
306 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  64.9 
 
 
302 aa  411  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  63.58 
 
 
306 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  45.09 
 
 
301 aa  212  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  36.59 
 
 
316 aa  198  9e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  36.73 
 
 
285 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  34.41 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 
302 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
301 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  36.36 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
381 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  32.97 
 
 
301 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  35.36 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  33.84 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  32.97 
 
 
303 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  30.69 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  32.97 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  32.57 
 
 
286 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  32.74 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  31.93 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  30.53 
 
 
320 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  30.63 
 
 
299 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  31.42 
 
 
526 aa  120  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  31.03 
 
 
298 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  31.72 
 
 
298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  30.34 
 
 
298 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  29.21 
 
 
405 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  28.97 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  30.25 
 
 
285 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  33.33 
 
 
254 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  35.5 
 
 
291 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  32.39 
 
 
258 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  32.65 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  32.67 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  32.99 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  32.49 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  31.48 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  28.69 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  32.89 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  33.16 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  30.69 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  36.55 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  28.64 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  30.41 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  28.19 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  28.7 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  32.7 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  26.62 
 
 
558 aa  69.3  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  30.09 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  29.55 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  27.56 
 
 
622 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  34.38 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  35.29 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  28.06 
 
 
626 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  33.67 
 
 
285 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  28.64 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  37.5 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  27.14 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  34.48 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  29.74 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  29.65 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  29.84 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.24 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  30.73 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3064  protein of unknown function RIO1  31.97 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.128757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  29.65 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  29.65 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  33.56 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  30.24 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  29.65 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  26.04 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  29.84 
 
 
282 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  29.69 
 
 
278 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  27.14 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3291  protein of unknown function RIO1  31.25 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  30.05 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  25.26 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  34.15 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  33.33 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  30.73 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  29.91 
 
 
1269 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  27.75 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  30 
 
 
284 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  31.52 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  31.85 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>