136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1180 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  77.9 
 
 		 268 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  77.15 
 
 		 266 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  74.91 
 
 		 266 aa  414  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  46.27 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  45.29 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  41.89 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  36.94 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  37.45 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  43.18 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  40.83 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  36.93 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  38.22 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  35.83 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  38.85 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  39.82 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  39.91 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  32.9 
 
 		 375 aa  118  7.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.850153 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  33.18 
 
 		 558 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  33.04 
 
 		 622 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  34.26 
 
 		 1269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  36.2 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  30.16 
 
 		 495 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  36.46 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  30.97 
 
 		 626 aa  99  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  34.05 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  36.97 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  32.27 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  32.08 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  32.08 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  32.08 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  32.08 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  31.46 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  31.46 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  33.18 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  31.46 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  31.6 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  31.46 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  31.92 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  31.92 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  32.39 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  32.86 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  32.13 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  31.78 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  33.16 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  27.88 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  32.39 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  32.56 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  31.6 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  30.99 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  29.49 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  27.19 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  34.35 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  32.38 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  28.7 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  32.39 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  33.49 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  29.05 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  30.43 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  33.18 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  31.3 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  30.66 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  31.58 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  30.33 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  31.6 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  28.7 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  29.82 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  31.13 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  29.17 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  30.84 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  30.14 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  31.78 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  37.5 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  28.93 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  35.62 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  29.33 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  29.3 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  30.09 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  30.09 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  30.09 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  39.39 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  28.64 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  38.81 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  30.19 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  30.81 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  30.81 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  27.7 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  30.81 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  30.09 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>