129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3358 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  95.09 
 
 
285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  91.58 
 
 
285 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  89.47 
 
 
285 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  88.03 
 
 
286 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  88.03 
 
 
286 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  88.03 
 
 
286 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  88.03 
 
 
286 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  77.39 
 
 
284 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  76.62 
 
 
285 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  75 
 
 
286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  71.83 
 
 
286 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  72.63 
 
 
287 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  73.59 
 
 
285 aa  428  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  71.73 
 
 
285 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  77.39 
 
 
284 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  74.26 
 
 
282 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  69.96 
 
 
285 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  70.18 
 
 
299 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  75.18 
 
 
283 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  75.18 
 
 
283 aa  407  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  75.18 
 
 
283 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  68.93 
 
 
283 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  67.14 
 
 
284 aa  397  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  69.42 
 
 
295 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  67.49 
 
 
297 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  67.63 
 
 
297 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  67.27 
 
 
284 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  70.08 
 
 
297 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  70.08 
 
 
297 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  70.45 
 
 
297 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  68.91 
 
 
298 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  69.29 
 
 
298 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  67.27 
 
 
298 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  68.91 
 
 
314 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  65.95 
 
 
282 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  64.49 
 
 
278 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  66.79 
 
 
285 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  66.04 
 
 
285 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  61.79 
 
 
282 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  62.01 
 
 
282 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  62.01 
 
 
283 aa  361  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  61.57 
 
 
284 aa  359  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  60.93 
 
 
308 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  60.42 
 
 
286 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  65.37 
 
 
286 aa  345  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  64.79 
 
 
275 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  65.15 
 
 
285 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  55.99 
 
 
286 aa  315  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  45.53 
 
 
450 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  44.63 
 
 
411 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  44.63 
 
 
417 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  44.81 
 
 
412 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  36.24 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  38.73 
 
 
291 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  35.55 
 
 
300 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  40.98 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  34.76 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  31.96 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  32.59 
 
 
240 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  36.2 
 
 
283 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  37.85 
 
 
387 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3291  protein of unknown function RIO1  37.62 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  33.95 
 
 
265 aa  94  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3064  protein of unknown function RIO1  36.97 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.128757 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  35.68 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  34.62 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  33.5 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  27.6 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  28.38 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.06 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  32.69 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  30.47 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  32.14 
 
 
1269 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  29.69 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  31.46 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
273 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  31.9 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  28.51 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  27.23 
 
 
558 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  30.67 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  29.25 
 
 
622 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  30.29 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  25.29 
 
 
495 aa  73.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  30.62 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  31.88 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  28.37 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  28.05 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  29.67 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  28.99 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  29.47 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>