138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2995 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  82.92 
 
 		 282 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  82.37 
 
 		 284 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  80.7 
 
 		 286 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  79.21 
 
 		 308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  77.78 
 
 		 283 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  74.19 
 
 		 282 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  69.09 
 
 		 297 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  68.21 
 
 		 297 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  67.54 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  65.83 
 
 		 298 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  65.95 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  65.95 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  65.59 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  65.23 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  67.16 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  64.87 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  64.87 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  64.87 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  64.87 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  67.8 
 
 		 297 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  64.52 
 
 		 285 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  65.45 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  67.42 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  67.8 
 
 		 297 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  66.42 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  66.31 
 
 		 285 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  63.35 
 
 		 285 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  65.25 
 
 		 285 aa  362  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  64.87 
 
 		 286 aa  362  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  64.52 
 
 		 284 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  63.33 
 
 		 282 aa  358  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  66.67 
 
 		 285 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  59.86 
 
 		 287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  63.33 
 
 		 284 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  60.14 
 
 		 278 aa  351  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  61.09 
 
 		 284 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  63.43 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  64.2 
 
 		 286 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  60.07 
 
 		 285 aa  346  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  64.6 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  64.6 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  64.6 
 
 		 283 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  59.35 
 
 		 283 aa  345  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  56.74 
 
 		 286 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  58.78 
 
 		 285 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  63.67 
 
 		 284 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  58.84 
 
 		 285 aa  338  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  60.67 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  56.36 
 
 		 286 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  47.11 
 
 		 450 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  45.87 
 
 		 417 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  45.87 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  46.19 
 
 		 412 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  36.36 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  34.29 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  35.65 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  36.67 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  37.75 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  38.24 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  33.96 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3064  protein of unknown function RIO1  36.19 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.128757 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  37.69 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  36.28 
 
 		 387 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3291  protein of unknown function RIO1  36.36 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  34.84 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  35.24 
 
 		 291 aa  88.6  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  35.38 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  35.81 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  32.26 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  30.09 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  34.12 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  30.25 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  32.37 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  29.86 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  28.51 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 338 aa  75.5  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  31.65 
 
 		 622 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  30.51 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  33.01 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  29.58 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  30.8 
 
 		 1269 aa  72.8  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  30.56 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  32.82 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  29.77 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  33.1 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  39.39 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  30.05 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  39.66 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.850153 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>