134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1785 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  64.03 
 
 
264 aa  342  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  50.39 
 
 
265 aa  254  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  47.6 
 
 
291 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  48.84 
 
 
259 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  46.34 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  44.44 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  48.35 
 
 
258 aa  232  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  47.48 
 
 
256 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  47.33 
 
 
288 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  48.92 
 
 
261 aa  224  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
306 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  42.08 
 
 
241 aa  186  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
273 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  40.38 
 
 
273 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
273 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  40.08 
 
 
273 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  37.83 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  43.03 
 
 
280 aa  168  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  41.1 
 
 
254 aa  168  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  39.32 
 
 
270 aa  168  8e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  42.29 
 
 
622 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  38.93 
 
 
495 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  34.57 
 
 
626 aa  152  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  39 
 
 
254 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  33.33 
 
 
375 aa  145  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  35.86 
 
 
266 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  35.83 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  37.12 
 
 
558 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  36.04 
 
 
1269 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
248 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  35.54 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  33.33 
 
 
412 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  32.86 
 
 
411 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  32.86 
 
 
417 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  31.19 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  30.73 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  29.22 
 
 
285 aa  89  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
301 aa  89  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  30.59 
 
 
297 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  30.59 
 
 
297 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  26.96 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  30.73 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  30.49 
 
 
285 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  28.83 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  28.83 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  28.83 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  28.83 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  32.49 
 
 
306 aa  85.5  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  29.63 
 
 
284 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  28.83 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  32.26 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  31.33 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  28.18 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  28.77 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  31.19 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  30.73 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  30.7 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  31.07 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  31.16 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  30.28 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  28.51 
 
 
320 aa  82  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  28.76 
 
 
306 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.28 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  29.86 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  29.61 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  28.7 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  29.36 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  31.03 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  27.03 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  30.52 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  29.82 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  30.09 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  26.34 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  30.94 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  28.45 
 
 
296 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  29.54 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  30 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  28.33 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  29.17 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  28.18 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  28.51 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  27.14 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  29.63 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  30.09 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  29.55 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  27.11 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  28.69 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>