126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2139 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  100 
 
 		 287 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  72.82 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  72.82 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  72.82 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  72.82 
 
 		 286 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  72.63 
 
 		 285 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  72.63 
 
 		 285 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  73.33 
 
 		 285 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  72.34 
 
 		 285 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  72.08 
 
 		 285 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  71.58 
 
 		 285 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  69.34 
 
 		 286 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  70.63 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  70.86 
 
 		 285 aa  410  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  69.58 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  71.63 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  68.99 
 
 		 286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  68.12 
 
 		 299 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2237  hypothetical protein  68.46 
 
 		 283 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.296498  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  71.99 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  67.4 
 
 		 282 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  64.54 
 
 		 297 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  63.73 
 
 		 297 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  66.79 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  65.22 
 
 		 278 aa  374  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  67.96 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  67.96 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  67.96 
 
 		 283 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  62.24 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  65.28 
 
 		 297 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  62.68 
 
 		 284 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  65.28 
 
 		 297 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  64.15 
 
 		 297 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  64.15 
 
 		 285 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  63.43 
 
 		 298 aa  358  6e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  60.14 
 
 		 282 aa  358  8e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  60.84 
 
 		 298 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  58.78 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  63.43 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  63.43 
 
 		 298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  59.86 
 
 		 282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  63.77 
 
 		 285 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  58.93 
 
 		 284 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  59.01 
 
 		 286 aa  348  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  58.78 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  63.57 
 
 		 286 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  65.66 
 
 		 285 aa  344  8.999999999999999e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1606  protein of unknown function RIO1  61.19 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000519001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  57.55 
 
 		 308 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  51.75 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  43.5 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  42.56 
 
 		 411 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  42.56 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  42.56 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  34.35 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3233  protein of unknown function RIO1  34.42 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  36.1 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  36.06 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6050  hypothetical protein  34.13 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6141  protein of unknown function RIO1  32.23 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487286  normal  0.0422512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  35.66 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  34.29 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  30.96 
 
 		 246 aa  99  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  33.96 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  36.92 
 
 		 387 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3291  protein of unknown function RIO1  33.02 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  30.87 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  30.73 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3064  protein of unknown function RIO1  31.13 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.128757 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  31.53 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  28.18 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  27.1 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  30.59 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  28.75 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  29.87 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  28.71 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  30.41 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  27.62 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  29.13 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  27.31 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  28.57 
 
 		 1269 aa  68.9  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  27.66 
 
 		 622 aa  67.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  24.36 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  28.24 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  27.03 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  28.17 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  26.75 
 
 		 626 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  27.57 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  27.85 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>