134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1850 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  77.9 
 
 
267 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  76.78 
 
 
266 aa  435  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  77.53 
 
 
266 aa  434  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 
280 aa  202  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  39.29 
 
 
241 aa  166  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  37.39 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  41.18 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  41.07 
 
 
265 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  35.95 
 
 
264 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  36.51 
 
 
288 aa  152  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  41.47 
 
 
256 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 
248 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  37.78 
 
 
258 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 
261 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  38.57 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  38.01 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  35.54 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 
306 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  34.36 
 
 
334 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
338 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  34.22 
 
 
273 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  33.78 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2858  predicted protein  30.57 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.850153 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46310  predicted protein  30.92 
 
 
1269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.789471  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0594  non-specific serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06363  Extragenic suppressor of the bimD6 mutationPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13330]  32.11 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.46432  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  36.62 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  29.34 
 
 
495 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01780  extragenic suppressor of bimD6 mutation, putative  29.96 
 
 
622 aa  99  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  29.39 
 
 
626 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  32.89 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  31.58 
 
 
285 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  35.51 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  31.9 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1866  hypothetical protein  30.14 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.012692  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  30.62 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1654  protein of unknown function RIO1  32.78 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000363916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  32.04 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  32.04 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  32.04 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  32.04 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0706  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  29.1 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0781  protein of unknown function RIO1  32.21 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000948828  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  30.24 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1682  protein of unknown function RIO1  31.1 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179514  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  31.44 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3113  protein of unknown function RIO1  30.54 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  32.7 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3802  protein of unknown function RIO1  31.86 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1753  protein of unknown function RIO1  31.1 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.107958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  31.58 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2195  protein of unknown function RIO1  31.1 
 
 
412 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  32.23 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  29.81 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  28.81 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  30.2 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  31.92 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  31.03 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  30.29 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  30.29 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  30.62 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3105  protein of unknown function RIO1  33.97 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.052568  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  31.53 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  30.62 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  30.41 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  30.77 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  25 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  29.38 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  30.81 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  31.58 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  31.1 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0977  hypothetical protein  29.25 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0194  protein of unknown function RIO1  30.81 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.892648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  31.58 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  30.57 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  29.67 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5882  protein of unknown function RIO1  28.37 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2139  protein of unknown function RIO1  29.13 
 
 
287 aa  72  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.262343  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  25.55 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  27.78 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3392  protein of unknown function RIO1  31.4 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  30.58 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2995  protein of unknown function RIO1  29.77 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  29.2 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  31.82 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  31.82 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  31.82 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  30.28 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1442  protein of unknown function RIO1  33.56 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296233  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  28.78 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0920719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  32.84 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06240  serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control  34.31 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  32.19 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>