103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0233 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0233  protein of unknown function RIO1  100 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0920719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1178  RIO-like kinase  43.1 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2321  protein of unknown function RIO1  36.46 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.243501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2603  protein of unknown function RIO1  33.68 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1194  protein of unknown function RIO1  32.23 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0434  hypothetical protein  30.18 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0482  protein of unknown function RIO1  32.95 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2841  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 381 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0659409  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0099  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  32.84 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  30.71 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2801  RIO-like kinase  31.8 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1049  protein of unknown function RIO1  30.69 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.290796  decreased coverage  0.00000000362034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2401  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2105  protein of unknown function RIO1  30.94 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  32.25 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0196  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.797756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0689  protein of unknown function RIO1  32.05 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0533  protein of unknown function RIO1  29.05 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.489947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  30.6 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0548  protein of unknown function RIO1  28.97 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0501425  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33379  predicted protein  31.02 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00101834 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30019  predicted protein  28.12 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0257867  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01960  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 		 526 aa  90.1  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  25.5 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40859  predicted protein  28.71 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0450714 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0945  protein of unknown function RIO1  26.44 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1001  protein of unknown function RIO1  26.44 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1680  protein of unknown function RIO1  26.44 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1217  protein of unknown function RIO1  28.15 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1162  protein of unknown function RIO1  24.91 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00763577  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0947  protein of unknown function RIO1  27.76 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0498  non-specific serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.30075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2456  protein of unknown function RIO1  29.05 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1785  hypothetical protein  26.12 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1850  protein of unknown function RIO1  28.78 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0857988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0513  protein of unknown function RIO1  28.37 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1749  hypothetical protein  29.6 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.963768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  26.67 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2792  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132105  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3650  RIO-like kinase  26.56 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0773  protein of unknown function RIO1  28.44 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.5402  hitchhiker  0.00560977 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1180  protein of unknown function RIO1  29.05 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2464  protein of unknown function RIO1  27.75 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000196699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2499  protein of unknown function RIO1  28.02 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1410  non-specific serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1626  non-specific serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0288  non-specific serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414498  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0852  non-specific serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1002  protein of unknown function RIO1  28.38 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.397015  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82126  protein serine kinase  27.31 
 
 		 495 aa  52.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.103532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 338 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0654  non-specific serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 248 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.106036  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0170  protein of unknown function RIO1  28 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0664  protein of unknown function RIO1  33.61 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0129863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3358  protein of unknown function RIO1  33.61 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.025527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1476  non-specific serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.525707  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0186  RIO-like kinase  28.33 
 
 		 254 aa  48.9  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2390  RIO1 family protein kinase  34.38 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000122794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1675  hypothetical protein  34.38 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000990489  normal  0.170325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2488  protein of unknown function RIO1  34.38 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.473839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3677  protein of unknown function RIO1  40.4 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000162658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0676  protein of unknown function RIO1  40.4 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0707  protein of unknown function RIO1  40.4 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.938334  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0697  protein of unknown function RIO1  40.4 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  21.48 
 
 		 334 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2037  protein of unknown function RIO1  25.12 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0611  hypothetical protein  29.91 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.14502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1558  putative RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  31.15 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0385053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3973  hypothetical protein  32.79 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4056  protein of unknown function RIO1  37.7 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1794  protein kinase domain-containing protein  39.39 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0695823  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0663  protein of unknown function RIO1  31.97 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.24041  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0163  protein of unknown function RIO1  30.91 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2197  protein of unknown function RIO1  30.37 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0148625  hitchhiker  0.00120245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0748  RIO1/ZK632.3/MJ0444 family protein  36.47 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0650  hypothetical protein  36.47 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0658  hypothetical protein  35.35 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63200  hypothetical protein  54.05 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5502  hypothetical protein  55.56 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1386  protein of unknown function RIO1  40.48 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3148  protein of unknown function RIO1  34.31 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0659  protein of unknown function RIO1  34.53 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2871  protein of unknown function RIO1  54.05 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3036  protein of unknown function RIO1  54.05 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50135  predicted protein  30.97 
 
 		 626 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1271  RIO-like kinase  31.4 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3868  protein of unknown function RIO1  30.09 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1034  RIO-type serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0400289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0811  protein of unknown function RIO1  55.56 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.63 
 
 		 1547 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2078  hypothetical protein  29.9 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2779  protein of unknown function RIO1  51.35 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4795  hypothetical protein  29.68 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.367167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2617  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000139973  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2912  hypothetical protein  48.65 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.562363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3183  protein of unknown function RIO1  35.63 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  22.97 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.59 
 
 		 1398 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>